Cell | 免疫疾病当中免疫细胞特异基因调控动态全景图

明治大学的研究课题人员和RIKEN Research研究课题所的同事们已经成立了首个针对自身病原体会缺陷结核病和自身水肿性结核病的基因脱氧核糖核酸资料库。期望这一资源能为病原体会结核病的演进提供原先见解，并不太可能更容易药物的注意到。科学研究们还期望，与病原体会系统性的基因脱氧核糖核酸组资料概要再次不太可能应用于诸如COVID-19等传染病的研究课题。

明治大学单项研究课题助理，临床风湿病学家，动态基因脱氧核糖核酸组学专家Mineto Ota博士话说：“要了解结核病，就必须深刻理解基因脱氧核糖核酸变异的动态。有了这个资料集，我们就可以将与结核病系统性的DNA脱氧核糖核酸转变的资料与对结核病发病机制非常重要的基因脱氧核糖核酸和细胞会子类联系起来。”Ota是该团队刊登在《Cell》时尚杂志上的篇名的主要作者，篇名歌名为“Dynamic landscape of immune cell-specific gene regulation in immune-mediated diseases”。该单项是与Chugai Pharmaceutical的科学研究们密切合作顺利完成的。

作者写道，病原体会抑制的结核病（IMD）还包括从自身病原体会缺陷到自身水肿的多种病理。他们指显现出，尽管IMD里面炎性蛋白酶的异常活动暗示病原体会细胞会动态暴发了转变，但是，“对于IMD的系统性基因脱氧核糖核酸甚至系统性细胞会子类大不相同。”

同类型基因脱氧核糖核酸组关联研究课题（GWAS）注意到了许多与IMD系统性的基因脱氧核糖核酸组位点。但是，在此类关联研究课题里面鉴定显现出的许多基因脱氧核糖核酸变异都设在可调基因脱氧核糖核酸“on”或“off”表述的DNA非编码区域，而不是设在基因脱氧核糖核酸编码脱氧核糖核酸里面。研究课题调查小组指显现出：“GWAS已经了解到了许多与复杂子代和结核病系统性的基因脱氧核糖核酸组位点，还包括IMD。这些变异里面的大多数都设在非编码基因脱氧核糖核酸组区域，特别是在是催化反应线圈，如增强子和位点。”

为了了解到催化反应DNA的动态，一种各有不同子类的基因脱氧核糖核酸组量化，称为表述定量子代基因脱氧核糖核酸位点（eQTL），旨在将DNA脱氧核糖核酸的差异性与基因脱氧核糖核酸表述的差异性联系起来。为了让eQTL资料，研究课题人员可以对催化反应DNA脱氧核糖核酸的目的、催化反应脱氧核糖核酸里面的变异如何因素其催化反应基因脱氧核糖核酸的表述以及这些基因脱氧核糖核酸表述差异性如何导致结核病做显现出越来越自大的猜测。

其它针对病原体会的eQTL研究课题已经在顺利完成里面，但越来越进一步的研究课题工作只还包括身心健康青年人，并健康检查了有限数量的细胞会子类。研究课题人员写道：“对身心健康供体病原体会细胞会的研究课题不太可能未能捕获结核病情况下下注意到的一系列eQTL效应。此外，虽然对病原体会细胞会的实验性诱导可以在某种程度上模拟结核病情况下，但并不总是凸显显现出肝细胞会的表征生态环境。”

Ota必需道：“水肿情况下下，病原体会细胞会的物理特性与身心健康情况下下的相同细胞会截然各有不同。与病原体会状况系统性的基因脱氧核糖核酸变异不太可能只在患病情况下下起作用，因此对于这种子类的基因脱氧核糖核酸研究课题，从真实腹泻身上获取样品非常重要。”

在他们最新路透社的研究课题里面，研究课题调查小组对79名身心健康青年人和337名被病因患有10种各有不同子类病原体会抑制结核病（还包括类风湿性关节炎、系统性心绞痛和系统性硬化症）的腹泻顺利完成了同类型基因脱氧核糖核酸组测序。所有青年人都是冲绳血统。

了解病原体会抑制的结核病不具备挑战性，因为尽管每种结核病在临床上都是各有不同的，但仍有许多分隔之西北侧，并且不具备相同病因的腹泻不太可能会表现显现出非常各有不同的腹泻。研究课题人员必需话说：“由于所有这些自然生态环境，一次学习一种病原体会抑制结核病的能力是有限的。但是，如果我们一起研究课题10种结核病，就可以越来越同类型面地了解这些子类的结核病。”

在完成同类型基因脱氧核糖核酸组测序后，研究课题人员从青年人的血液样品里面萃取28种各有不同子类的病原体会系统性细胞会，并测量了这些细胞会里面的基因脱氧核糖核酸表述。“我们在概要里面看到，每种病原体会细胞会子类都有各有不同的eQTL结果，这可以告诉我们细胞会子类二者之间基因脱氧核糖核酸催化反应的差异性，以及哪种细胞会子类对于演进哪种结核病至关重要。”研究课题人员话说。

作者报告话说，“在基因脱氧核糖核酸表述量化里面，我们在一个平台上对多个IMD顺利完成比较，使我们能够详细描述每个结核病（腹泻）的特征，并识别与单个结核病酪氨酸系统性的基因脱氧核糖核酸，以及在组合成IMD里面亢进的渠道……我们的资料集使我们能够样品每个特定细胞会子类里面eQTL效应的表征（结核病）背景驱动的不良因素。”

研究课题人员将得到的资源定名为明治大学病原体会细胞会基因脱氧核糖核酸表述概要（ImmuNexUT），并话说它代表了使用东亚血统青年人成立的最大的eQTL资料集。他们总结道：“我们确定了病原体会细胞会子类酪氨酸的eQTL效应，还包括在此早先未路透社的罕见细胞会子类，它们在表征水肿先决条件下的自然生态环境，以及这些eQTL与IMD基因二者之间的非常大关联。”

“到目前为止，在这一领域，大规模的基因脱氧核糖核酸组和动态基因脱氧核糖核酸组研究课题主要是为了让北美**顺利完成的，尽管群体自然生态环境对于精准理解基因脱氧核糖核酸组动态至关重要。”研究课题人员话说，“这个冲绳受试者的eQTL概要对于克服这种以北美为里面心的偏见，结合北美的资料集进一步研究课题DNA变异的动态，也不具备重要意义。”

研究课题人员期望ImmuNexUT资料库将一直激增，并再次为腹泻带来越来越好的结果。他们话说：“与早先路透社的资源相比，我们的资料集不具备独具而有利的结构上，还包括同类型面的病原体会细胞会分作、**二者之间病原体会状况的转变以及所谓的非北美**。”